أن يكون القسم هو المرجع الأول في علوم وأبحاث الطاقـة والتقنيـة النوويـة وفي مجالات هندسة الوقاية الإشعاعية وهندسة الفيزياء الطبية وتطبيقاتها وإعداد كوادرها في المملكة.
إعداد وتأهيل الكوادر الهندسية ذوي الكفاءة العالية في مجالات الفيزياء الطبية والحماية الإشعاعية والهندسة النووية بما يتماشى مع المعايير والمتطلبات الدولية واحتياجات المجتمع.
تأسس قسم الهندسة النووية ضمن أقسام كلية الهندسة عند إنشائها في عام 1394/1395 هـ (1977 م) وذلك لما لوحظ من أهمية لهذا التخصص وقد روعي في البرنامج المقدم أن يفي بحاجة المملكة العربية السعودية الحالية والمستقبلية.